[1] の輪講を基本にして、細胞内の化学反応ダイナミクスに対する単純な数理モデリングの方法を学びながら、遺伝子制御に関する細胞現象、特にエピジェネティクスに関連した数理モデリングを考察する。このスタディグループの一番の目標は、この題材の基に集まった異なる背景を持つ参加者たちが、お互いに議論するために必要な共通言語を学ぶことである。理想的には、このスタディグループが終了時に、参加者同士が遺伝子制御に関する化学反応現象に関して、数理モデリングを有効に使用しながら議論できるようになることである。その中から、参加者自身の研究に対する何らかのヒントを見つけられる可能性もあろう。1回のスタディグループを時間的に２つにわけ、一つの時間帯で [1] の輪講、もう一つの時間帯でクロマチン, エピジェネティクス関連の論文紹介を行う。大まかに、輪講は修士学生が担当し、博士学生や教員はそれぞれ持ち寄った論文紹介を行うことを考えている。しかしながら役割や題材は、グループの状況を考慮しながら柔軟に再設定する。例えば適宜、ネットワーク上確率過程モデリング [2] やReaction network theory [3] について補足等を考えている。

[1] “Mathematical modelling in systems biology: An introduction” B. Ingalls, MIT Press (2013).
[2] “Networks: An introduction” M. Newman, Oxford Univ. Press (2010).
[3] “Chemical reaction network: Graph-theoretical approach”, O. N. Temkin, A. V. Zeigarnik, D. G. Bonchev, CRC Press (1996).